Mutko je členem výkonného výboru od roku 2009. O znovuzvolení na jedno ze čtyř evropských míst se chtěl ucházet 5. dubna na kongresu FIFA v Helsinkách.
Dalšími kandidáty jsou člen výkonného výboru UEFA Sándor Csányi z Maďarska, šéf islandského svazu Geir Thorsteinsson, bývalý hráč AC Milán a šéf svazu Černé Hory Dejan Savičevič a předseda kyperské federace Kostakis Kutsokumnis.
Mutka také vyšetřuje etická komise FIFA kvůli jeho roli v rozsáhlém skandálu s organizovaným dopingem v Rusku. Pokud by byl potrestán, přišel by mimo jiné o místo v čele ruského svazu a musel by odstoupit z vedení organizačního výboru mistrovství světa 2018.
Mutko v politice působil už při nástupu do výkonného výboru FIFA, federace se však posléze rozhodla zpřísnit vlastní pravidla zakazující vměšování politiky do fotbalu. Proti rozhodnutí komise se bývalý ruský ministr sportu může odvolat k mezinárodní arbitráži CAS.
